敦煌现有两个火车站，分别是敦煌市火车站和柳园站。
敦煌市火车站
嘉峪关、兰州和西安，都有直达敦煌火车站的列车：
嘉峪关—敦煌站：距离400多公里，全程5小时左右，票价：约55/100元（硬座/硬卧）；
兰州—敦煌站：有两趟列车都是夕发朝至，全程14小时左右，票价：约150/250元（硬座/硬卧），这两趟列车在旅游高峰时期经常爆满，有时连硬座票都买不到；
西安－敦煌站：全程22小时左右，票价：约200/360元（硬座/硬卧）。
敦煌火车站地址：敦煌市区以东，约10公里处。乘坐3路公交车，即可到达市区（沙洲镇）。
柳园火车站
位于兰新铁路线上，可直达上海、北京西、西安、成都、兰州，乌鲁木齐等大中城市。北京—柳园站，约25小时，上海—柳园站，约34小时。
柳园火车站地址：敦煌市西北方向，约130公里处。从柳园火车站到敦煌市区（沙洲镇），不分昼夜都有汽车，中巴15元，全程2个小时；拼车约30元/人；出租车约100元/车。
柳园火车站市区代售处：敦煌宾馆西侧一楼，售票时间7:30-13:00，15:00-19:00。